Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ttbk1Q6PCN3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms