Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgd6Q69ZL1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms