Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SspnQ62147 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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