Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim25Q61510 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms