Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccne1Q61457 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccne1Q61457 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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