Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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