Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc5a6Q5U4D8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc5a6Q5U4D8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms