Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim38Q5SZ99 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Trim38Q5SZ99 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim38Q5SZ99 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms