Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
C2cd3Q52KB6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms