Protein–RNA interactions for Protein: Q501J6

Ddx17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx17Q501J6 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx17Q501J6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx17Q501J6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx17Q501J6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx17Q501J6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx17Q501J6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx17Q501J6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx17Q501J6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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