Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc3lQ4KL14 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms