Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q3USZ8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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