Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fchsd2Q3USJ8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fchsd2Q3USJ8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms