Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms