Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx27Q3UHD6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx27Q3UHD6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms