Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms