Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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