Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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LcorlQ3U285 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LcorlQ3U285 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LcorlQ3U285 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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LcorlQ3U285 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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