Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q3U1D9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q3U1D9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms