Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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