Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hddc2Q3SXD3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms