Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccbe1Q3MI99 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms