Protein–RNA interactions for Protein: Q30KP3

Defb20, Beta-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb20Q30KP3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb20Q30KP3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms