Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd2Q149F1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd2Q149F1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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