Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
MestQ07646 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MestQ07646 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MestQ07646 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms