Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cdx4Q07424 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms