Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Thbs3Q05895 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Thbs3Q05895 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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