Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoc2Q05020 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoc2Q05020 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms