Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cxcr5Q04683 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms