Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pax8Q00288 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pax8Q00288 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms