Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pitx2P97474 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms