Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H3f3aP84244 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms