Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Hoxd13P70217 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Hoxd13P70217 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Hoxd13P70217 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Hoxd13P70217 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Hoxd13P70217 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd13P70217 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms