Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rab3cP62823 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms