Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms