Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lsm6P62313 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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