Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf5P56477 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf5P56477 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Irf5P56477 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf5P56477 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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