Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NcanP55066 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NcanP55066 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NcanP55066 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms