Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb4P54761 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms