Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CastP51125 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CastP51125 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CastP51125 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CastP51125 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CastP51125 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CastP51125 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CastP51125 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CastP51125 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CastP51125 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CastP51125 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CastP51125 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CastP51125 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CastP51125 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms