Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtpreP49446 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtpreP49446 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms