Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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VdrP48281 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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VdrP48281 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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VdrP48281 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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