Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd4P46935 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nedd4P46935 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd4P46935 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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