Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ItgavP43406 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms