Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms