Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms