Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TpoP35419 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TpoP35419 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TpoP35419 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TpoP35419 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TpoP35419 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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TpoP35419 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TpoP35419 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
TpoP35419 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TpoP35419 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TpoP35419 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms