Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoc1P34928 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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