Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprmP28828 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PtprmP28828 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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