Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RxraP28700 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RxraP28700 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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